近日,星空版游戏大厅下载安装联合生科院徐玮研究团队和南方科技大学陈曦研究团队与Bio-Rad Laboratories合作在Nature Protocols杂志上发表了题为“Single-nucleus chromatin accessibility and gene expression co-profiling by ISSAAC-seq”的技术论文,描述了一项同时适用于低通量多孔板和多种高通量微流控平台的ATAC + Gene expression多组学测序技术ISSAAC-seq实验及分析流程。

在单细胞中同时检测染色质开放性和转录组,可以同时记录细胞生命活动中染色质状态和基因转录情况,整合多组学数据能够提供有关组织中细胞类型的关键信息,精细描绘动态过程中的细胞状态,揭示基因调控网络,帮助了解生命的过程。
ISSAAC-seq实验设计在细胞原位通过两轮差异化的Tn5转座反应,分别标记ATAC-seq和RNA-seq序列,混合扩增建库后测序。实验基本流程为:分离细胞核-开放染色质标记-原位逆转录-转录组标记-酶切缺口补齐及单链DNA消化-单细胞分离-文库扩增。由于在RNA原位逆转录时使用了含有测序接头序列的特异逆转录引物,可将后续RNA-seq数据与ATAC数据分离,进行数据分析。模块化的设计使得ISSAAC流程可移植到包含Bio-Rad dscATAC在内的多种单细胞平台上。优化后的反应体系可在细胞系、小鼠大脑皮层组织、人外周血单核细胞等多种实验材料中实现稳定、高质量的检测。

星空版游戏大厅下载安装联合生科院徐玮教授和南方科技大学陈曦教授为本文共同通讯作者。星空版游戏大厅下载安装联合生科院为本文第一单位。Bio-Rad Laboratories 为本研究项目提供了技术支持和帮助。
原文链接:https://www.nature.com/articles/s41596-025-01304-y#Sec56